蛋白质Edit——加polar H，加Kollman电荷后，Grid——Macromolecule——choose，自动保存pro1.pdbqt

配体 Ligand——Input——QuickSetup，自动保存.out.pdbqt

receptor = clusters_0001_model1.pdbqt

ligand = hypericin.out.pdbqt

center_x = 2.148 （第一个文件可以由Docking——output——Vina生成）

center_y = 3.704

center_z = -2.81

size_x = 74.55   （大于30*30*30，要增加exhaustiveness）

size_y = 74.55

size_z = 74.55

out = cluster1_hypericin_out.pdbqt

log = cluster1_hypericin_out.log

exhaustiveness=24（可以多少个CPU设置多少个，并行计算，exhaustiveness控制一个docking过程重复计算多少次，越高花时间越长，但也不要设置特别大，也没有意义，要在效率和准确度找一个平衡点）

num_modes=30 （不一定输出30个，可能只找到